当地时间11月25日,南非国家传染病研究所(NICD)发表声明表示,已在南非检测到一种新型新冠病*变种B.1.1.。一天后,世界卫生组织将其命名为“奥密克戎(Omicron)”。
▲11月4日,南非首都比勒陀利亚的一家柳叶刀实验室首次发现了新冠病*常规检测数据中的异常情况
世卫组织在声明称,首例已知的奥密克戎感染是来自11月9日在南非收集的一个标本。不过,据南非媒体29日报道,早在11月4日,南非首都比勒陀利亚的一家实验室便首次发现了新冠病*常规检测数据中的异常情况。(此前报道:新冠最新变种11月初已出现,专家:各国旅行禁令恐“为时已晚”)
11月初报告:
S基因缺失,意味着“可能发生突变”
当地时间11月4日下午,初级科学家艾丽西亚·维穆伦(AliciaVermeulen)在实验室当天处理的大约个测试结果中发现了一个异常的阳性结果,而她当时并没有意识到此次观察将引发一系列关系到全球的事件。
▲B.1.1.*株共有32处刺突蛋白突变
这项“异常”的测试没有检测到一种特定的基因,即制造尖峰蛋白的S基因,虽然在样本中发现了可以将其判定为阳性的另外两个基因。但是,S基因的缺失标志着有些东西可能已经发生了变化,这用专业术语来说是“S基因靶标失效(S-GeneTargetFailure,SGTF)”。实际上,S基因“消失”表明它可能发生了突变,只有在这种情况下,它才无法被检测到。
“这激起了我的好奇心。我们想知道是什么导致了S基因靶标失效,因为早期我们在阿尔法变种上看到了类似的情况。”拥有医学病*学硕士学位的维穆伦后来在接受媒体采访时说。
在注意到这个异常之后,维穆伦便通知了该实验室的负责人和经理。第二天,她发现了一个类似的异常结果。在接下来的一周里,又发现了更多……维穆伦表示,这种带有S基因靶标失效的阳性结果数量出现迅速增加。
维穆伦回忆道,在新冠疫情的高峰期,实验室处理的样本一天最多可达0份。在过去一个多月的疫情平稳期,她负责分析检测结果,“起初我们认为这可能又是阿尔法变种,但我们还是决定密切