程少为 https://baijiahao.baidu.com/s?id=1678953855783569549&wfr=spider&for=pc突然出现的Omicron到底是从哪里来的？现在科学家们正试图弄清楚它是如何进化的。
本文来源：Nature
南非约翰内斯堡的人们，靠近首次发现Omicron病例的地方。图片来源：KimLudbrook/EPA-EFE/Shutterstock
在南非首次发现冠状病*SARS-CoV-2的Omicron变种后仅两个多月，它就以比以前任何版本更快的速度在世界范围内传播。科学家们已经在多个国家/地区对其进行了追踪，但仍然对一个关键问题感到困惑：Omicron是从哪里来的？
没有将Omicron与其前身连接起来的透明传输路径。相反，该变体具有一系列不寻常的突变，它完全在研究人员的视野之外进化。Omicron与早期的变种（例如Alpha和Delta）如此不同，以至于进化病*学家估计其最接近的已知遗传祖先可能可以追溯到一年多前，即年年中之后的某个时间。南非开普敦大学的计算生物学家达伦·马丁说：“它突然出现了。”
Omicron的起源问题不仅仅是学术上的重要性。位于加拿大萨斯卡通的萨斯喀彻温大学疫苗和传染病组织的病*学家安吉拉拉斯穆森说，弄清楚这种高度传染性变体是在什么条件下出现的，可能有助于科学家了解新变体出现的风险，并建议采取措施将其最小化。“试图减轻你甚至无法远程绕开的风险是非常困难的，”她说。
Omicron如何传播得如此之快？
高病*载量不是答案
世界卫生组织最近成立的新型病原体起源科学咨询小组(SAGO)在1月份开会讨论Omicron的起源。SAGO主席、南非比勒陀利亚大学医学病*学家MarietjieVenter表示，该组织预计将在2月初发布一份报告。
在该报告发布之前，科学家们正在研究三种理论。尽管研究人员已经对数百万个SARS-CoV-2基因组进行了测序，但他们可能只是错过了一系列最终导致Omicron的突变。或者，作为长期感染的一部分，这种变异可能在一个人身上进化出突变。或者它可能在其他动物宿主中出现，例如老鼠或大鼠。
瑞士巴塞尔大学的计算生物学家RichardNeher表示，目前，无论研究人员偏爱哪种想法，“通常都归结为直觉，而不是任何有原则的论点”。“它们都是公平的游戏，”南非约翰内斯堡国家传染病研究所的医学科学家JinalBhiman说。“每个人都有他们最喜欢的假设。”
最疯狂的基因组
研究人员一致认为Omicron是最近才出现的。它于年11月上旬在南非和博茨瓦纳首次被发现；此后，回顾性测试于11月1日至3日在英格兰以及11月2日在南非、尼日利亚和美国发现了较早的个体样本。对数百个已测序基因组中的突变率以及病*在12月之前在人群中传播的速度进行了分析，发现它的出现时间早于去年9月底或10月初左右。在南部非洲，Omicron可能从约翰内斯堡和比勒陀利亚之间人口稠密的城市豪登省传播到其他省份和邻近的博茨瓦纳。
但由于约翰内斯堡是非洲大陆最大机场的所在地，该变种可能出现在世界任何地方——只是由于该国复杂的基因检测而在南非被发现。
Omicron的突出之处在于其显著数量的突变。
与在中国武汉分离的原始SARS-CoV-2病*相比，该变体有50多个突变。其中约30种导致刺突蛋白1中氨基酸的变化，冠状病*利用该蛋白附着并与细胞融合。以前
